Pharmacological potential of 3-((indol-3-yl)methyl)-6-methyl-[1,2,4]triazolo[3,4-b][1,3,4]thiadiazine-7-carbohydrazide and its N′-arylidene carbohydrazides

Abstract

The aim of the study was an in silico evaluation of ADME parameters and molecular docking results for 3-((indol-3-yl)methyl)-6-methyl-[1,2,4] triazolo[3,4-b][1,3,4]thiadiazine-7-carbohydrazide and its N′-arylidene carbohydrazide derivatives, to substantiate the feasibility of their synthesis and further experimental investigations. Materials and methods. The study was performed using computational methods. Drug-likeness and pharmacokinetic parameters were calculated with the SwissADME online platform. Molecular docking was carried out using AutoDock Vina and Discovery Studio Visualizer, applying the optimal parameters of the docking grid and analysis of interactions between the ligands and active sites of the target proteins. The following targets were selected: lanosterol 14α-demethylase (CYP51, PDB: 5V5Z), cyclooxygenase-2 (COX-2, PDB: 5IKR), peptide deformylase from Staphylococcus aureus (PDF, PDB: 1Q1Y), peptide deformylase from Escherichia coli (PDF, PDB: 1G2A), and anaplastic lymphoma kinase (ALK, PDB: 2XP2). Мета роботи – in silico оцінювання параметрів ADME та результатів молекулярного докінгу для 3-((індол-3-іл)метил)-6-метил-[1,2,4] тріазоло[3,4-b][1,3,4]тіадіазин-7-карбогідразиду та його N′-ариліденкарбогідразидних похідних для обґрунтування можливості їх синтезу та подальших експериментальних досліджень. Матеріали і методи. Дослідження здійснили, застосувавши обчислювальні методи. Параметри лікарської подібності та фармакокінетики розраховували за допомогою онлайн-платформи SwissADME. Молекулярний докінг здійснили за допомогою AutoDock Vina та Discovery Studio Visualizer, використали оптимальні параметри докінгової сітки та проаналізували взаємодії між лігандами й активними центрами цільових білків. Обрано такі мішені, як ланостерол 14α-деметилаза (CYP51, PDB: 5V5Z), циклооксигеназа-2 (COX-2, PDB: 5IKR), пептиддеформілаза з Staphylococcus aureus (PDF, PDB: 1Q1Y), пептиддеформілаза з Escherichia coli (PDF, PDB: 1G2A) та кіназа анапластичної лімфоми (ALK, PDB: 2XP2).